통상적인 화학적 염색방법의 결점을 극복한, 게놈을 핵산 서열에 따라 한가지 패턴으로 염색시키며 그 패턴을 프로오브의 핵산 서열을 변화시키므로써 요구하는 바대로 변화시킬 수 있는 세포 유전학적인 염색 방법 및 프로오브 조성물을 제공한다. 예를 들어, 만성 골수성 백혈병 및 급성 임파구 백혈병과 관련된 유전자 재배열을 구별하는 방법에 있어서, (1) 프로브를 예상되는 유전자 재배열 위치와 근접하게 위치하는 표적 염색체 물질과 하이브리드화를 형성시키고, (2) (1)의 프로오브로부터의 시그날들의 근접성 및/또는 기타 다른 특성들을 관찰 및/또는 측정하고, (3) 단계(2)에서 수득된 관찰 및/또는 측정 결과들로부터 유전자 재배열이 일어났는지 여부를 측정하는 단계들로 이루어지는 유전자 재배열의 검출방법.