라벨을 기질로 부터 AGT를 포함하는 융합 단백질에 전달하기 위한 O 6 -알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제(AGT)를 사용한 방법이 개시되어 있다. 이 방법은 새로운 물리적 또는 화학적 특성을 융합 단백질에 도입하는 분자를 융합 단백질에 부착하는 것에 의해 시험관내 및 시험관내에서 모두 융합 단백질을 검출 및/또는 조작하는 것을 허용한다. 이러한 분자의 예는 분광학적 프로브 또는 리포터 분자, 친화성 태그, 반응성 라디칼을 생성하는 분자, 크로스-링커, 단백질-단백질 상호작용을 매개하는 리간드 또는 융합 단백질의 고정화에 적합한 분자를 포함한다.