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Genetic Diversity Analysis on Artificial Triploid Stock of Paralichthys olivaceus using Microsatellite DNA Marker

논문 개요
기관명 NDSL
저널명 漁業科學進展 = Progress in fishery sciences
ISSN 2095-9869,
ISBN

논문 개요

논문저자 및 소속기관 정보
저자(한글) LIU, Hui,WU, Zhi-hao,LI, Zhen,ZHU, Xiang-ping,YOU, Feng,SONG, Zong-cheng,LI, Jun,HU, Jin-wei
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
빌행연도 2015-01-01
초록 미소부수체 유전 마커기술을 이용하여 3배체 넙치(Paralichthys olivaceus) 개체군과 2배체 대조군 개체군을 비교 분석하였다. 2012년에 저온 충격법으로 유도하고 11원령까지 사육한 3배체 및 같은 시기의 2배체 대조군의 개체를 각기 32마리를 선택한 후, 고염도 추출법을 통하여 근육 조직의 총 DNA를 추출하였다. 선별해낸 21쌍의 미소부수체 프라이머를 이용하여 PCR 증폭을 진행하고, 14% 폴리아크릴아마이드 겔 전기 영동법(polyacrylamide gelelectrophoresis, PAGE)으로 분리한 후, 인공 판독과 분석을 진행하였다. 연구 결과, 21개 미소부수체 부위는 모두 다형성을 나타냈으며, 2배체와 3배체 개체군의 평균 대립유전자 수(A), 유전자형 총 수, 평균 유효 대립유전자 수(a e ), 관찰된 이형 접합성(observed heterozygosity, H O )의 평균값과 기대된 이형 접합성(expected heterozygosity, H e )의 평균값은 각각 5.6와 5.0, 190과 142, 3.7과 2.8, 0.613과 0.868, 0.681과 0.629였다. 3배체와 2배체 개체군의 다형성 정보 함량(polymorphism information content, PIC)은 각각 0.642과 0.589, 개체 식별률(power discrimination, DP)은 0.660과 0.609, 비친부 배제율(probability of paternity exclusion, PPE)은 0.482과 0.399, 그 누적 개체 식별률과 비친부 배제율은 0.999에 달하였는데, 이는 선별해낸 부위가 고식별 능력을 갖춘 유전 마커에 속하기에 향후 넙치의 자성발생(gynogenesis) 개체군의 유전적 변이 분석 및 유전 육종의 심층 연구에 응용할 수 있음을 설명한다. 3배체와 2배체 개체군 사이의 유전적 거리(genetic distance, D)는 0.312, 유전적 유사계수(genetic similarity, I)는 0.732, 유전자 분화 계수(coefficient of gene differentiation, G ST )는 0.971였다. 상기 결과는 3배체 유도가 넙치의 유전덧 구조에 일정한 영향을 미치며, 이로부터 3배체 유전적 다양성 수준이 2배체에 비해 어느 정도 감소되고 2배체와 3배체 넙치의 유전자형도 일정한 차이가 존재한다는 것을 설명한다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART75847269
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과학기술표준분류
ICT 기술분류
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주제어 (키워드) Paralichthys olivaceus Triploid Artificial induction Microsatellite DNA marker Genetic variation 넙치 3배체 인공 유도 미소부수체 유전적 다양성