본 발명은 크로마토그래피법을 이용하여 천연원(혈액 및 요) 및 재조합원(유전학적으로 형질전환된 포유류의 세포 배양액)내에 포함된 시알산 함량이 높은 당 단백질(에리스포이에틴과 같은 적혈구 조성 인자)과 같은 생물학적으로 활성인 단백질을 신속하고 효율적으로 정제하는 방법에 관한 것이다. C4 또는 C8 쉬를 포함하는 액상 크로마토그래피의 분리법으로 유체내 에리스로포이에틴을 수지에 선택적으로 흡착시키고 pH4.5-8.0인 수성 에탄올 용액으로 흡착된 에리스로포이에틴을 용리시켜 정제하거나, 유체를 pH7.0에서 이온 교환 크로마토그래피 분리법을 실행시켜 양이온 수지에 에리스로포이에틴을 선택적으로 흡착시켜 pH4.0-6.0인 수성산으로 처리하여 에리스로포이에틴의 pKa값보다 큰 pKa값의 흡착된 오염물질을 용리시키고, pH7.0인 수성염 처리로 에리스로포이에틴을 용리시켜 유체로부터 정제한다.
